Трудовой договор после реорганизации путем слияния

И правильно сделала. Потому что реорганизация, даже путем слияния, не является основанием для их расторжения.

Да, с предупреждением за 2 месяца после окончания реорганизации.
Если работник не согласен работать в новых условиях, то трудовой договор с ним прекращается по основанию "Отказ работника от продолжения работы в связи с реорганизацией" (п.6 ч 1, ст.77 ТК РФ).

lenatonk, но некоторые кадровики увольняют работников и в порядке перевода, при этом не указывая в письмах, приказах, заявлениях, что причина такого увольнения - реорганизация.