НДС

Помогите пожайлуста разобраться с такой проблемой. Унитарное предприятие освобождено от уплаты по  НДС  ст 145 НК РФ, но распорядитель средст в данном случае Агенство требует с\ф, чтобы выписывали с НДС мотивируют это тем, что контракт был подписан с НДС. Можно было бы заплатить НДС, но Агенство (распорядитель) к возмещению НДС не ставит. Что если мы не праплати налог, нарушение какой статьи НК РФ при налоговой проверке в нашем случае будет. Жду помощи коллеги.