Опубликовано в журнале "Некоммерческие организации в России" №5 год - 2014
Семенихин В.В.,
Руководитель
«Экспертбюро Семенихина»
Развитие науки и техники оказывает огромное влияние на экономику любой страны, и Российская Федерация в этом плане не является исключением. Понимая всю важность научной деятельности, государство стимулирует развитие науки, предоставляя субъектам хозяйственной деятельности, занятым в данной сфере, различные виды налоговых льгот, в том числе и по НДС. В данной статье мы поговорим о льготах по НДС в области научной деятельности и о порядке их применения.
В качестве льгот с точки зрения гл. 21 НК РФ рассматриваются такие налоговые преференции, как возможность освобождения от уплаты налога на основании ст. 145 и 145.1 НК РФ, использование нулевой или пониженной ставки НДС, а также осуществление операций, освобождаемых от налогообложения, перечень которых определен ст. 149 НК РФ.
Статья 149 НК РФ представляет собой основную «льготную» статью, в которой законодательно определены льготы, дающие право не уплачивать налог:
- при реализации определенных видов товаров (работ, услуг);
- определенным категориям налогоплательщиков;
- при осуществлении конкретного вида хозяйственных операций.
Льготам по НДС в сфере научной деятельности, относящимся к первой из перечисленных групп льготных операций, посвящены подп. 16 и 16.1 п. 3 ст. 149 НК РФ.
Так, подп. 16 п. 3 ст. 149 НК РФ определено, что на территории Российской Федерации освобождается от налогообложения выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ (далее – НИОКР) за счет средств бюджетов бюджетной системы Российской Федерации, средств Российского фонда фундаментальных исследований, Российского фонда технологического развития и фондов поддержки научной, научно-технической, инновационной деятельности, созданных для этих целей в соответствии с Федеральным законом от 23.08.1996 № 127-ФЗ «О науке и государственной научно-технической политике»; выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ учреждениями образования и научными организациями на основе хозяйственных договоров.
Обратите внимание!
В данной редакции подп. 16 п. 3 ст. 149 НК РФ действует начиная с 1 января 2014 г., на что указывает Федеральный закон от 23.07.2013 № 215-ФЗ «О внесении изменений в гл. 21 и 25 части второй Налогового кодекса Российской Федерации и отдельные законодательные акты Российской Федерации».
В свою очередь, подп. 16.1 п. 3 ст. 149 НК РФ выводит из-под налогообложения выполнение организациями научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ, относящихся к созданию новых видов продукции и технологий или к усовершенствованию производимой продукции и технологий, если в состав научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ включаются следующие виды деятельности:
- разработка конструкции инженерного объекта или технической системы;
- разработка новых технологий, то есть способов объединения физических, химических, технологических и других процессов с трудовыми процессами в целостную систему, производящую новую продукцию (товары, работы, услуги);
- создание опытных, то есть не имеющих сертификата соответствия, образцов машин, оборудования, материалов, обладающих характерными для нововведений принципиальными особенностями и не предназначенных для реализации третьим лицам, их испытание в течение времени, необходимого для получения данных, накопления опыта и отражения их в технической документации.
Порядок применения налоговой льготы (подпункт 16 пункта 3 статьи 149 НК РФ)
В первую очередь отметим, что данной льготой могут воспользоваться любые плательщики НДС (как организации, так и индивидуальные предприниматели), выполняющие НИОКР, финансирование (софинансирование) которых осуществляется за счет средств:
- бюджетов бюджетной системы Российской Федерации;
- Российского фонда фундаментальных исследований;
- Российского фонда технологического развития;
- фондов поддержки научной, научно-технической, инновационной деятельности, созданных для этих целей в соответствии с Федеральным законом от 23.08.1996 № 127-ФЗ «О науке и государственной научно-технической политике».
Аналогичное мнение изложено в письме Минфина России от 12.05.2011 № 03-0708/145, а также в письме ФНС России от 27.09.2013 № ЕД-16-3/186.
Обращаем ваше внимание на то, что в новой редакции льготы, установленной подп. 16 п. 3 ст. 149 НК РФ, содержится прямая отсылка к бюджетной системе Российской Федерации, что снимает спорные вопросы в части налогообложения НИОКР, выполняемых за счет бюджетов иностранных государств.
Между тем ранее в письме УФНС России по г. Москве от 22.10.2004 № 24-11/68726 отмечено, что льгота распространяется лишь на выполнение НИОКР, финансируемых из российских бюджетов различных уровней, в силу чего при оплате работ за счет бюджета иностранного государства применение льготного режима налогообложения будет признано неправомерным.
Интересно, что, выводя из-под налогообложения выполнение НИОКР, финансирование которых производится за счет указанных источников, законодатель не поясняет, что в гл. 21 НК РФ следует понимать под научно-исследовательскими и опытно-конструкторскими работами, в силу чего у налогоплательщиков могут возникнуть проблемы с квалификацией выполняемых работ в качестве НИОКР.
При отсутствии в гл. 21 НК РФ самостоятельного понятия «НИОКР» чиновники рекомендуют налогоплательщикам пользоваться нормами ГК РФ. Как следует из ст. 769 ГК РФ, по договору на выполнение научно-исследовательских работ исполнитель обязуется провести обусловленные техническим заданием заказчика научные исследования, а по договору на выполнение опытно-конструкторских и технологических работ – разработать образец нового изделия, конструкторскую документацию на него или новую технологию, а заказчик обязуется принять работу и оплатить ее. Таким образом, в целях НДС под НИОКРами понимаются любые научные исследования, проводимые исполнителем на основании договора на выполнение научно-исследовательских, опытно-конструкторских или технологических работ в соответствии с техническим заданием заказчика, а также разработка образцов новых изделий, конструкторской документации на них или новой технологии.
Аналогичные разъяснения по данному поводу дают и специалисты финансового ведомства в письме Минфина России от 04.11.2004 № 03-04-08/106.
Согласны с таким подходом и суды, о чем свидетельствуют постановление ФАС Московского округа от 02.07.2009 № КА-А40/5975-09 по делу № А40-83611/08-33-413, постановление ФАС Поволжского округа от 19.02.2008 по делу № А55-6449/2007-44, постановление ФАС Московского округа от 12.09.2008 № КА-А40/8498-08 по делу № А40-60452/07-33-363 и др.
Любая льгота, использованная налогоплательщиком, как известно, должна быть подтверждена документально, однако в подп. 16 п. 3 ст. 149 НК РФ законодатель умалчивает о том, какими документами она подтверждается. Так как в данном случае ключевое значение имеет источник финансирования НИОКР, то, по мнению автора, основанием для применения льготы может выступать договор на выполнение работ с указанием источника финансирования, а также письменное уведомление (справка) заказчика, которому выделены средства непосредственно из бюджета, в адрес исполнителей и соисполнителей о выделенных ему бюджетных средствах для оплаты указанных работ. Аналогичные разъяснения на этот счет содержатся как в письме Минфина России от 27.12.2012 № 03-07-07/139, так и в письме УФНС России по г. Москве от 16.02.2009 № 16-15/013746.
Заметим, что воспользоваться льготным налоговым режимом по данному основанию может не только прямой исполнитель работ, но и соисполнители, привлекаемые исполнителем для выполнения указанных работ по заключенному договору. На это указывают и финансисты в письме Минфина России от 26.11.2013 № 03-07-07/51147.
Не возражают по этому поводу и арбитры, на что указывают, в частности, постановление ФАС Поволжского округа от 31.05.2011 по делу № А55-13057/2010, постановление ФАС Московского округа от 15.12.2008 № КА-А40/11493-08 по делу № А4017078/08-127-45 и ряд других.
Обратите внимание!
С 1 января 2014 г. Минобрнауки России формирует и ведет единую государственную систему учета научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ гражданского назначения (далее – информационная система). В силу этого все исполнители НИОКР с указанной даты обязаны предоставлять Минобрнауки России сведения об открытых НИОКР гражданского назначения в целях их учета в указанной информационной системе. Формы направления сведений о НИОКР гражданского назначения и требования к их заполнению утверждены постановлением Правительства РФ от 12.04.2013 № 327 «О единой государственной информационной системе учета научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ гражданского назначения» (вместе с «Положением о единой государственной информационной системе учета научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ гражданского назначения»).
Этим же документом утвержден порядок подтверждения главными распорядителями бюджетных средств, осуществляющими финансовое обеспечение НИОКР и выполняющими функции заказчика таких работ. Поэтому не исключено, что налоговые органы будут связывать применение данной льготы с наличием сведений о НИОКР в информационной системе, а при их отсутствии – признавать использование льготного режима налогообложения неправомерным со всеми вытекающими последствиями.
Однако, по мнению автора, такой подход к использованию льготы не соответствует нормам гл. 21 НК РФ. Ведь гл. 21 НК РФ не ставит использование данной льготы в зависимость от наличия сведений в указанной информационной системе, в силу чего такие претензии налоговиком можно будет признать не соответствующими закону.
О том, что события могут развиваться по такому сценарию, говорит существовавшая до 1 января 2014 г. арбитражная практика по данному вопросу.
Напомним, что до указанной даты все открытые НИОКР, выполняемые российскими организациями любой организационно-правовой формы, подлежали обязательной регистрации во Всероссийском научно-техническом информационном центре (далее – ВНТИЦ) в соответствии с приказом Миннауки России от 17.11.1997 № 125 «Об утверждении Положения о государственной регистрации и учете открытых научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ», который сейчас утратил силу. Соответственно налоговики связывали льготу по НИОКР с наличием такой регистрации, а в ее отсутствие признавали ее использование незаконным.
Но налогоплательщики успешно отстаивали свое право на льготу в суде, о чем, например, говорят постановление ФАС Московского округа от 08.05.2007 по делу № КА-А40/3755-07, постановление ФАС Московского округа от 23.09.2009 № КА-А40/9487-09 по делу № А40-10222/08-20-16, постановление ФАС Поволжского округа от 26.06.2008 по делу № А55-17064/07 и др.
Заметим, что учреждениям образования и научным организациям законодатель в плане применения льготы, установленной подп. 16 п. 3 ст. 149 НК РФ, предоставляет более широкие возможности – они вправе не облагать налогом НИОКР, выполняемые и в рамках хозяйственных договоров. На то, что у указанных исполнителей источник финансирования работ не влияет на использование льготного налогового режима, указывает и Минфин России в письме от 09.10.2007 № 03-07-11/464. Аналогичные разъяснения на этот счет приведены в письме Минфина от 16.02.2009 № 16-15/013746.
Однако при использовании льготы в рамках хозяйственного договора организация, выполняющая НИОКР, должна подтвердить статус научной организации.
Напомним, что понятие «научная организация» раскрыто в ст. 5 Федерального закона от 23.08.1996 № 127-ФЗ «О науке и государственной научно-технической политике». Согласно указанной норме научными организациями признаются юридические лица независимо от организационно-правовой формы и формы собственности, общественные объединения научных работников, осуществляющие в качестве основной деятельности научную и (или) научно-техническую деятельность.
Иначе говоря, научной организацией может признаваться любая российская компания, подтвердившая, что ее основным видом деятельности является научная и (или) научно-техническая деятельность.
Напомним, что в настоящее время организации самостоятельно определяют свой основной вид деятельности. Согласно п. 9 Правил отнесения видов экономической деятельности к классу профессионального риска, утвержденных постановлением Правительства РФ от 01.12.2005 № 713 (далее – Правила), для коммерческих организаций основным видом экономической деятельности является тот вид, который по итогам предыдущего года имеет наибольший удельный вес в общем объеме выпущенной продукции и оказанных услуг.
Для некоммерческих организаций основным видом экономической деятельности является тот вид деятельности, в котором по итогам предыдущего года было занято наибольшее количество работников организации.
На основании п. 11 Правил основной вид деятельности ежегодно подтверждается в порядке, установленном приказом Минздравсоцразвития России от 31.01.2006 № 55 (далее – Порядок). При этом в соответствии с п. 3 Порядка для подтверждения основного вида деятельности необходимо ежегодно в срок не позднее 15 апреля представлять в соответствующий территориальный орган ФСС РФ заявление о подтверждении основного вида экономической деятельности и справку-подтверждение основного вида экономической деятельности.
Следовательно, с точки зрения НДС в качестве научной организации может выступать организация любой формы собственности и ведомственной принадлежности, подтвердившая в указанном порядке факт осуществления в качестве основной деятельности научную и (или) научно-техническую деятельность.
О том, что с таким подходом согласны и сами налоговики, свидетельствует письмо ФНС России от 15.03.2006 № ММ-6-03/274@ «О применении освобождения от налогообложения налогом на добавленную стоимость в отношении научно-исследовательских работ, выполняемых учреждениями науки».
Соглашаются с этим и суды, о чем свидетельствует, например, постановление ФАС Московского округа от 12.09.2008 № КА-А40/8498-08 по делу №А40-60452/07-33-363.
Порядок применения налоговой льготы (подпункт 16.1 пункта 3 статьи 149 НК РФ)
Указанная норма законодательства по НДС предоставляет возможность использования льготного режима налогообложения организациям, выполняющим научно-исследовательские, опытно-конструкторские и технологические работы, относящиеся к созданию новой продукции и технологий или к усовершенствованию производимой продукции и технологий.
Правда, использование льготного режима налогообложения по данному основанию признается правомерным лишь при условии того, что в состав научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ включаются следующие виды деятельности:
- разработка конструкции инженерного объекта или технической системы;
- разработка новых технологий, то есть способов объединения физических, химических, технологических и других процессов с трудовыми процессами в целостную систему, производящую новую продукцию (товары, работы, услуги);
- создание опытных, то есть не имеющих сертификата соответствия, образцов машин, оборудования, материалов, обладающих характерными для нововведений принципиальными особенностями и не предназначенных для реализации третьим лицам, их испытание в течение времени, необходимого для получения данных, накопления опыта и отражения их в технической документации.
Иными словами, этой льготой могут воспользоваться любые организации – разработчики, осуществляющие любой из перечисленных в подп. 16.1 п. 3 ст. 149 НК РФ видов деятельности. Причем в данном случае совершенно не важен источник финансирования работ, осуществляемых организацией-разработчиком. Главное, чтобы работы, выполняемые фирмой-разработчиком, отвечали всем требованиям, перечисленным в подп. 16.1 п. 3 ст. 149 НК РФ.
Рассматривая возможность использования льготных налоговых режимов, нельзя не отметить, что ст. 149 НК РФ делит все виды льгот, установленные данной статьей, на обязательные и необязательные. К первой категории льгот относятся льготы, установленные пп. 1 и 2 ст. 149 НК РФ: от них отказаться налогоплательщик не вправе даже тогда, когда использование льготного налогового режима невыгодно налогоплательщику.
Обращаем ваше внимание на то, что с 1 января 2014 г. налогоплательщики не выставляют счета-фактуры по налогооблагаемым операциям, совершаемым с применением льгот, предусмотренных ст. 149 НК РФ. На это указывает п. 3 ст. 169 НК РФ, обновленный Федеральным законом от 28.12.2013 № 420-ФЗ «О внесении изменений в статью 27.5-3 Федерального закона «О рынке ценных бумаг» и части первую и вторую Налогового кодекса Российской Федерации».
Другая категория льгот, состав которых определен п. 3 ст. 149 НК РФ, применяется налогоплательщиками в добровольном порядке. Льготы по науке относятся к разряду льгот, используемых по инициативе налогоплательщика, поэтому при желании фирма или коммерсант, выполняющие НИОКР, могут от нее отказаться.
Отказ от льгот зачастую осуществляют те налогоплательщики, которые помимо операций, освобожденных от налогообложения, осуществляют операции, облагаемые налогом, и в этой ситуации законодательство по НДС требует от налогоплательщика обязательного ведения раздельного учета таких операций, на что указывает п. 4 ст. 149 НК РФ.
Поскольку организация такого учета довольно сложна, то многие, не желая его вести, принимают решение об отказе от льготы. Чтобы отказаться от использования льготы, предусмотренной п. 3 ст. 149 НК РФ, налогоплательщик должен написать заявление об отказе в применении льготного режима и представить его в налоговый орган до 1-го числа того налогового периода, с которого он намерен отказаться от использования льготы или приостановить ее использование. Такое правило установлено п. 5 ст. 149 НК РФ. Заметим, что форма заявления на отказ от льготы не установлена, в силу чего оно подается налогоплательщиком в произвольной форме.
Обратите внимание!
Оказаться от использования льготы можно как в отношении одной льготы, предусмотренной любым подпунктом п. 3 ст. 149 НК РФ, так и в отношении нескольких. Но при этом следует иметь в виду, что отказ от льготы возможен только в отношении всех осуществляемых налогоплательщиком операций. Закон запрещает применять или не применять льготный режим налогообложения выборочно – в зависимости от того, кто является покупателем (приобретателем) соответствующих товаров (работ, услуг).
Исполнителям НИОКР, решившим отказаться от применения добровольных льгот по науке, нужно помнить о том, что такое решение приведет к тому, что выполняемые ими НИОКР будут облагаться налогом в общем порядке.
В то же время, если НИОКР связаны с космической деятельностью, они будут облагаться налогом по нулевой ставке, на что указывает подп. 5 п. 1 ст. 164 НК РФ. Аналогичные разъяснения на этот счет приведены в письме Минфина России от 03.08.2012 № 03-07-15/95.
В начале статьи мы отметили, что своего рода льготой по НДС в сфере науки можно считать и освобождение от уплаты налога на основании ст. 145.1 НК РФ. Воспользоваться таким освобождением могут исключительно организации – участники проекта «Сколково».
Напомним, что согласно ст. 10 Федерального закона от 28.09.2010 № 244-ФЗ «Об инновационном центре «Сколково» (далее – Закон № 244-ФЗ) участником проекта «Сколково» может стать любая российская организация, отвечающая следующим условиям:
1) организация создана исключительно в целях осуществления исследовательской деятельности в области:
- энергоэффективности и энергосбережения, в том числе разработки инновационных энергетических технологий;
- ядерных технологий;
- космических технологий, прежде всего в области телекоммуникаций и навигационных систем (в том числе создание соответствующей наземной инфраструктуры);
- медицинских технологий (в области разработки оборудования, лекарственных средств);
– стратегических компьютерных технологий и программного обеспечения;
2) постоянно действующий исполнительный орган организации, а также иные органы или лица, имеющие право действовать от имени фирмы без доверенности, постоянно находятся на территории Центра (заметим, что выполнение данного условия обязательно начиная с 1 января 2016 г., что следует из п. 2 ст. 21 Закона № 244-ФЗ).
Если российская организация отвечает всем перечисленным условиям, то она может стать участником проекта «Сколково» и, соответственно, вправе претендовать на налоговые преференции, установленные законодательством для указанной категории субъектов.
Отметим, что на основании п. 1 ст. 10 Закона № 244-ФЗ организация получает статус участника проекта сроком на 10 лет со дня включения ее в реестр участников проекта.
Согласно п. 1 ст. 145.1 НК РФ организации – участники проекта «Сколково» имеют право на освобождение от обязанностей налогоплательщика НДС, связанных с исчислением и уплатой налога, в течение 10 лет со дня получения ими статуса участника проекта. Данное освобождение не распространяется на операции по ввозу товаров на территорию Российской Федерации и иные территории, находящиеся под ее юрисдикцией, а также на исполнение обязанностей налогового агента.
Обратите внимание!
Воспользоваться данным освобождением участник проекта «Сколково» может только в том случае, если у него при годовом объеме выручки от реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав) более 1 млрд руб. совокупный размер прибыли, рассчитанный нарастающим итогом с 1-го числа того же года, не превышает 300 млн руб. Причем размер прибыли, о которой идет речь, определяется по правилам гл. 25 «Налог на прибыль организаций» НК РФ.
Поскольку в ст. 145.1 НК РФ речь идет о праве, то участник проекта «Сколково», отвечающий условиям ст. 145.1 НК РФ, сам оценивает, будет ли он применять освобождение по НДС, воспользоваться которым он может уже с 1-го числа месяца, следующего за месяцем получения организацией статуса участника проекта.
Право на использование освобождения по НДС по данному основанию носит уведомительный характер, поэтому те, кто решил им воспользоваться, должны письменно уведомить об этом свою налоговую инспекцию. Причем сделать это нужно не позднее 20-го числа месяца, следующего за месяцем, в котором участник проекта «Сколково» начал использовать освобождение от уплаты налога.
Форма письменного уведомления об использовании права на освобождение по НДС для «сколковцев» утверждена приказом Минфина России от 30.12.2010 № 196н «Об утверждении форм документов организации, получившей статус участника проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом «Об инновационном центре «Сколково» (вместе с Порядком заполнения формы расчета налоговой базы по налогу на прибыль организации – участника проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом «Об инновационном центре «Сколково») (далее – Приказ Минфина России № 196н).
Вместе с указанным уведомлением участник проекта, решивший использовать освобождение по НДС, должен направить в налоговую инспекцию документы, подтверждающие его статус участника проекта «Сколково», предусмотренные Законом № 244-ФЗ.
Следует отметить, что организация, уведомившая налоговый орган об использовании права на освобождение по НДС, выделять суммы налога на добавленную стоимость в документах, предъявляемых покупателям, не должна, на что обращено внимание в письме Минфина России от 16.01.2012 № 03-07-14/03.
Обратите внимание!
Особенности учета организаций, получивших статус участников проекта «Сколково» в соответствии с Законом № 244-ФЗ, утверждены приказом Минфина России от 08.02.2011 № 14н «Об утверждении Особенностей учета в налоговых органах организаций, получивших статус участников проекта по осуществлению исследований, разработок и коммерциализации их результатов в соответствии с Федеральным законом «Об инновационном центре «Сколково».
Статья 145.1 НК РФ допускает возможность добровольного отказа от уже используемого права на освобождение, но только в отношении всех осуществляемых участником проекта операций. Добровольный отказ от данной льготы подтверждается участником проекта путем направления в налоговый орган соответствующего уведомления по сроку не позднее 1-го числа налогового периода, в котором участник проекта намерен отказаться от применения освобождения по НДС.
Имейте в виду, что участник проекта «Сколково», отказавшийся от применения освобождения по НДС по собственной инициативе, не вправе претендовать на него повторно.
Помимо добровольного отказа от освобождения, участник проекта «Сколково» может потерять право на его применение. Основаниями для утраты права на освобождение по НДС выступают потеря организацией статуса участника проекта «Сколково» и нарушение лимита по совокупному размеру прибыли, на что указывает п. 2 ст. 145.1 НК РФ. Причем в первом случае организация утрачивает право использования освобождения с момента утраты статуса участника проекта «Сколково», во втором – с 1-го числа налогового периода, в котором совокупный размер прибыли превысил 300 млн руб.
Обратите внимание!
Сумма НДС за налоговый период, в котором произошла утрата статуса участника проекта или имело место превышение совокупного размера прибыли, установленного законом, подлежит восстановлению и уплате в бюджет в установленном порядке с взысканием с участника проекта соответствующих сумм пеней.
Поскольку данная льгота предоставляется государством сроком на 10 лет, то подтверждать право ее использования участник проекта должен ежегодно. Согласно п. 5 ст. 145.1 НК РФ по истечении 12 календарных месяцев применения освобождения не позднее 20-го числа последующего месяца участник проекта должен представить в налоговый орган:
- документы, подтверждающие статус участника проекта и предусмотренные Законом № 244-ФЗ;
- выписку из книги учета доходов и расходов или отчет о финансовых результатах участника проекта, подтверждающие годовой объем выручки от реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав);
- расчет совокупного размера прибыли (если годовой объем выручки от реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав) превысил 1 млрд руб.). Отметим, что данный расчет представляется одновременно с документами, указанными выше, начиная с года, следующего за годом, в котором годовой объем выручки от реализации товаров (работ, услуг, имущественных прав) превысил 1 млрд руб. Форма расчета совокупного размера прибыли утверждена приказом Минфина России № 196н;
- уведомление о продлении использования освобождения.
Если участник проекта по истечении 12 календарных месяцев более не намерен использовать освобождение, то вместо уведомления о продлении использования льготы предоставляется уведомление на отказ от нее.
Имейте в виду, что сумму «входного» налога по товарам (работам, услугам), приобретенным организацией – участником проекта «Сколково» до начала применения освобождения на основании ст. 145.1 НК РФ, но не использованным в налогооблагаемой деятельности, налогоплательщик должен восстановить и уплатить в бюджет. Сделать это нужно в последнем налоговом периоде перед направлением в налоговый орган уведомления об использовании права на освобождение путем уменьшения налоговых вычетов.
Если организация – участник проекта утратила право на применение освобождения, то на основании п. 8 ст. 145.1 НК РФ по товарам (работам, услугам), приобретенным в период использования освобождения, но использованным после его утраты, она сможет принять к вычету сумму «входного» налога.
Вопрос представления налоговой декларации по НДС организацией, получившей статус участника проекта «Сколково», рассмотрен Минфином России в письме от 15.05.2012 № 03-07-15/45 в котором указано, что организации, получившие статус участников проекта «Сколково» и применяющие освобождение от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой НДС в порядке, установленном ст. 145.1 НК РФ, должны представлять в налоговый орган налоговую декларацию в случае исполнения ими обязанностей налогового агента по НДС, выставления покупателям счетов-фактур с выделенной суммой налога, а также при исчислении налога в соответствии со ст. 174.1 НК РФ.
Если вышеназванное освобождение применяется участниками проекта «Сколково» со 2-го или 3-го месяца квартала и до применения этого освобождения данные организации признавались налогоплательщиками НДС, то декларация по налогу за соответствующий налоговый период представляется ими в налоговые органы по месту их учета в срок, предусмотренный п. 5 ст. 174 НК РФ.
В завершение отметим, что с 1 января 2014 г. налогоплательщики НДС отчитываются в налоговой инспекции в электронном формате, на что указывает п. 5 ст. 174 НК РФ.
